醫院手術室凈化工程的的布局方式，通常，醫學界認為，手術主要以“接觸”為主，因此杜手術室設備、人員與污染源的接觸，便成為這類手術室布局的主要目的。在手術室凈化中央島型布局中，由電梯運來的材料，通過中央潔凈廳送入各個手術室。使用后物品，由外廊運出，而且醫生、護士使用的洗手池，也要設置在外廊。

單流向型：通常來說，手術室凈化需要嚴格遵守潔、污分流的原則，不管是患者、醫護人員還是物品都要單向流，潔、污兩者之間徹底不交叉是避免手術的佳布局方案。然而隨著手術室數量的增多，這類布局的平面流向和設計變得越來越復雜。 

單走廊型：單走廊型醫院手術室凈化工程布局秉承的是“污物不擴散”的觀點。在這種布局中，手術后的器材、廢棄物、污染物須經過打包后再運出。在這類布局中須要帶前室，用來在術前、術后對手術物品進行徹底的。   

雙走廊型：雙走廊型醫院手術室凈化工程布局是常見的布局形式，其原則也是止交叉。雙走廊型又分為污物型和清潔型。污物型雙走廊布局中，手術后的器材、廢棄物需要由外走道送出，醫務人員、患需要由內走道出入。清潔型雙走廊布局中，其平面布置與污物型相似，不同之處在于手術前醫生、器械經過清潔后由潔凈走廊進入室內術后由潔凈走廊退出。

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